מסקנות וועדת החמישה

מסקנות הוועדה והמלצותיה דחו את טענותיהם של בן-גוריון ותומכיו בדבר "מרד פוליטי בצבא" ולמעשה תמכו בעמדתם של גלילי וראשי האגפים במטכ"ל. הוועדה המליצה להקים קבינט מלחמה מצומצם מבין חברי הממשלה, להפריד בין הדרג הצבאי למדיני, לאסור על שר הביטחון להתערב בעניינים מקצועיים של המטכ"ל, ליצור דרג ביניים בין שר הביטחון והרמטכ"ל בדמותם של שני מנהלים כלליים של הצבא (שיכהנו בדרגת סגני שרים) ולאסור על שר הביטחון לקבוע מינויים על דעת עצמו בלבד. מסקנות הוועדה היוו מהלומה קשה לבן-גוריון והוא הודיע ליושב ראש הוועדה על התפטרותו מתפקידיו כראש הממשלה ושר הביטחון כבר ב- 6 ביולי, בטרם התכנסה הוועדה לישיבתה האחרונה.
וועדת החמישה, שאנשיה ייצגו את כל קצות הקשת הפוליטית אישרה את נאמנותו של הפלמ"ח לרשויות המוסמכות ויצאה כנגד מתן סמכות בלתי מוגבלת לשר הביטחון. אולם למרות מסקנות נחרצות אלו, עתידים היו הדברים להתפתח באופן שונה, ואופן התפתחותם הביא לבסוף לפירוק